Science前沿:用信息论解释动植物间的军备竞赛
在植物与植食性昆虫组成的生态系统中,不同物种在相互作用的过程中, 彼此适应,形成了一个相互影响的协同适应系统。近期Sicence的一项研究从气味信息的角度,讨论动植物协同进化中的军备竞赛,对研究生态网络内部的交流机制很有启发。同期的一篇相关评论文章对该话题进行了全新解答,本文是该评论文章的编译。
论文题目:
Using information theory to decode network coevolution
论文地址: https://science.sciencemag.org/content/368/6497/1315
1. 生态系统中的信息军备竞赛
图1:该研究框架示意图
2. 信息论如何被用于生态网络
自从1950年克劳德·香农(Claude Elwood Shannon)提出信息论以来,很多学者探讨了信息在进化和生态中起的作用[1,2]。然而,对于信息如何具体发挥作用,尤其是如何将其整合到在进化的框架下的问题,由于数据的缺少,以及缺乏能够将信息和适应度映射起来的方法,目前仍知之甚少[3]。
图2:克劳德·艾尔伍德·香农,信息论及数字通信时代的奠基人。扫码可阅读集智百科词条,了解更多信息
该文基于植物用于生长发育的次级代谢产物,将植物和昆虫(AP),和植物和自身释放的信息素(PV)这两个二分网络结合了起来。前者描述了植物与植食性昆虫的对应关系,而后者描述了植物与自身释放化学物质类型的对应关系。该文在位于墨西哥的Chamela-Cuixmala自然保护区内热带森林中,采集鳞翅目昆虫的幼虫以及对应宿主植物的叶片,通过野外调查与室内实验相结合的方式,阐明自然生态群落中植物与植食性昆虫间的“军备竞赛”过程。
3. 模型如何反映交流中的不对称性
在自然生态系统中,交流是不对称的,例如食草动物在取食植物的过程中,交流双方的利益是相互冲突的。食草动物需要识别出哪种植物可以食用,而植物需要避免让自己成为食物。该研究的目标,是通过将这两个网络信息层面的描述,用一个简单的共进化模型,解决为植物和食草动物定义进化适应度的问题。
根据该模型的规则,研究模拟了影响这两个二分网络交互的基因突变情况。在模拟中随机选择一个植物-释放信息素(挥发性有机物)的配对,按照一定概率,增加或去除这样的连接,由此增加或降低信息素的可能性组合。通过熵,计算该信息素在动物识别时的不确定性,计算该植物的适应性得分。如果适应性得分高于之前,那么则接受该信息素对信号库的扩充。
特别值得注意的是,一般的交流网络是通过降低噪音,以提高交流通道的效率;而在该模型中,一种植物释放信息素,是为了提高交流时的变化性,从而使捕食者更加迷惑。在信息论的框架下,即提高食草动物选择植物的不确定性。
同样的进化过程,之后被用于植物和昆虫的网络。植物和昆虫的连接,根据相反的适应度评价方式,被增加到网络中,或从网络中被删除。在该例中,植物要降低信息素的可能范围,从而减少不确定性,以确保授粉。
由此,适应度(fitness measure)可以通过信息论中的另一种熵来定义,它描述了昆虫基于植物-信息素网络矩阵,决定专门针对一种植物授粉而得到的对植物的改进的程度。而这反映了两个网络间的信息传递。因此,优化中的两个约束条件必须被同时满足:植物产生信息素和昆虫的专业分工。
4. 模型预测准确地反映了真实情况
图4:模型预测和实际结果的对比
上图展示了通过模拟,不同数量的信息素(横轴)及其对应的互信息熵(纵轴),左图代表植物通过信息素吸引昆虫,称为编码;右图代表食草动物通过信息素决定可否食用该植物,称为解码;图中虚线代表真实场景中信息素的个数,可以看出,两幅图中,真实数量和模拟展示的刚刚能够最大化互信息的数量是一致的。
由网络模型预测得出的数据,和包括食草植物和植物之间密集网络,以及昆虫专业授粉集合中的实地真实数据拟合的很好。上述结果和初始条件无关,适用于稀疏及稠密的交互网络。上述发现说明,植物释放的化学信息素,在植物和食草动物,以及植物和昆虫之间的共演化中发挥着重要作用[4]。
5. 该建模框架的扩展性应用场景
生物个体的生命活动离不开物质与能量,而存储在生物体DNA中的信息,以及个体之间的信息传递,则是驱动生物学发展的关键[5]。
在生态学中,信息论能针对能量转移网络[6],以及植物授粉者网络[7],给出可验证的预测。该研究提供的理论框架,将协同进化(coevolution)动力学和网络结构联系在了一起。该框架可以应用在和植物共生的微生物所产生的化学信息素上[8],以及与多种真菌,植物,以及微生物共生的植物根部的研究中[9]。
在更广的视野上,该研究提出的形式化的对网络协同进化的研究,可以帮助形成生态系统中经由协同进化学习的理论[10]。进一步来看,语言进化中不同需求形成的张力,和本研究的昆虫植物之间相互作用有类似之处,都需要最小化交流的成本,并产生能够解释语言普遍组织规律的统计分布[11]。
参考文献:
(参考文献可上下滑动)
编译:郭瑞东
审校:彭莳嘉、李周园、曾祥轩
编辑:张希妍
文末投票:
文字不过瘾,直播搞起来?
相互适应,协同进化,生命如此多姿多彩!你一定意犹未尽,最好论文作者直播搞起~
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