论文题目：Quantifying the local adaptive landscape of a nascent bacterial community

论文来源：Nature Communications

论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-022-35677-5

有机体所有可能突变的适应度效应在很大程度上决定演化适应的动力学。然而，这种适应性景观在演化过程中是否以及如何变化，特别是在生态多样化和群落组成变化时，仍然知之甚少。Nature Communications 的这项研究试图通过分析两种密切相关的生态型（“L”和“S”）在大肠杆菌长期演化实验（LTEE）中出现后不久形成的稳定群落来填补这一空白。

研究者设计了全基因组条形码转座子文库，以测量在许多不同的生态相关条件下，共存菌株及其祖先中所有可能基因敲除的入侵适应度效应。结果发现，尽管单个敲除的行为有特殊性，但在遗传背景和群落组成中，适应度效应变化的统计模式是一致的。此外，适应度效应与许多条件下的演化结果相关，可能揭示了适应模式的变化。该研究结果揭示了生态效应和上位性效应如何相互结合，在新生生态群落中塑造适应性景观。

图1. 测量突变的适应度效应。

图2. 适应度效应分布的统计特征和单个突变与环境密切相关。