生命作为最典型的复杂系统,从细胞到个体再到群体,在不同层次上都展现出各种复杂性,引发不同学科研究者的兴趣。为了促进生命复杂系统的跨学科交流,我们策划“生命复杂性”系列读书会,组织精读和讨论相关研究。

“生命是什么”是探索生命复杂性必然面对的问题,在科学史上争议不断,至今没有清晰的答案。而个体,作为生命的基本单位,其边界常常并不清晰。

11月12日(周四)晚,读书会成员十三维,将进行第二期分享,介绍关于体信息理论”的最新研究。分享将在B站直播,报名读书会可参与深度讨论交流。

本期分享基于圣塔菲研究所现任所长、进化生物学家 David Krakauer 等人在2020年3月发表的一篇论文。论文中提出了“个体信息理论”,利用信息熵和互信息为个体下定义,并推导出三种独特形式的个体类型。这为刻画个体和环境的关系、定量研究生命系统提供了新的理论依据。

这篇论文的引申结论是,即使没有体细胞等明确物理边界,在合适的观察者和测量下,从分子到文化,一些多层次、高分布的适应性系统,也可以被识别成生命个体。

论文题目:

The information theory of individuality

论文地址:

https://link.springer.com/article/10.1007/s12064-020-00313-7#Sec10


论文通讯作者、进化生物学家、圣塔菲研究所所长 David Krakauer

关于该研究已有解读文章:


本次分享涉及部分信息论基础知识,建议提前预习论文或上述解读文章。

分享人十三维是某航企数据运营主管、集智俱乐部常驻作者,毕业于首都师范大学数学系,长期关注复杂系统与认知科学等跨学科研究。


直播信息与报名方式


直播时间:周四(11月12日) 19:00-21:00


参与方式 1:腾讯会议(需报名参加系列读书会)

参与方式 2:集智俱乐部B站直播


扫描下方二维码,点击「我要听」报名,内附B站直播地址:




第二期内容介绍


大纲:


  • 从 How 到 What:探寻生命的本质

    • 古典和生物学的生命定义

    • 物理学的什么定义 

    • 个体与群体

  • 从信息论到生命个体

    • 过程哲学和格式塔

    • 从信息熵到信息个体

    • 生命-环境交互结构

  • 三种信息个体

    • 有机个体

    • 群落个体

    • 环境驱动个体 

  • 个体度量的可视化模拟实例

    • 调节系统作用的三个参数

    • 随机环境

    • 有记忆环境 

  • 个体信息论与其他理论关系

    • 自创生理论

    • 自由能量原理

    • 整合信息论 

 

 

内容简介:


(一)从 How 到 What:探寻生命的本质

引子。首先讲述为什么要关注生命本质的定义,在历史上对生命定义几种定义取向和方法,以及为什么从薛定谔发展出的物理学和信息论是更为本质的方法。


(二)从信息论到生命个体

本部分将讲述个体信息理论如何基于过程哲学和演化格式塔思想,从信息论的基本概念:信息熵、联合熵、互信息…等针对生命-环境系统构建数学模型,推理出生命系统输入-输出信息流的主导部分,以及分别由这些主导项定义的三种信息生命个体。 


(三)三种信息个体

本部分将讲述三种信息生命形式主导项所代表不同生命类型的特点,生物实例以及它们之间的关系。


(四)个体度量的可视化模拟实例

这部分讲述在生命-环境交互系统中,分别在随机环境和有记忆环境下,模拟信息熵、互信息、有机个体、群落个体、环境驱动个体随着不同系统交互耦合参数的变化情况,以及对这些过程的生物解释。


(五)个体信息论与其他理论关系

最后谈一下个体信息理论与其他通用的生命理论框架,如自创生理论、自由能量原理、整合信息论,如何通过生命信息主导项和耦合参数联系起来,以及各个理论在生命起源和演化中的位置。



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系列读书会报名:


生命是什么?生命怎样起源?生命怎样演化?这些是对生命现象的本质追问,除了传统的生物学研究,如今有大量来自信息、物理、计算机领域的工具方法,正在揭开生命复杂性谜题。


集智俱乐部策划“生命复杂性”系列读书会。我们欢迎正在从事相关问题研究的老师、同学报名参与交流,不限专业背景。特别欢迎有交叉学科背景的朋友参加。读书会的分享交流以论文、专著为基础,需要一定的背景知识与论文阅读能力。如果你缺少研究基础但兴趣特别浓厚,也欢迎报名。


时间:11月5日起,每周四晚19:00-21:00,持续约两个月

模式:线上闭门读书会;收费-退款的保证金模式;读书会成员认领解读论文

费用:399元/人


目前已经有60+的朋友参与,包括多位相关领域的研究者。读书会成员的背景标签词云:


单位职位分布


专业领域分布


兴趣领域分布


后续主题:

第三期(11月12日):复杂性研究的生物学视角

第四期(11月19日):生物物理与生命复杂性

第五期(11月26日):生命起源的研究历程

更多主题开放招募中~


了解读书会具体规则、报名读书会请点击下方文章:

生命复杂性系列读书会:从信息和物理视角探索生命的内在逻辑




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