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Complexity Express 一周论文精选

以下是2021年1月18日-24日来自Complexity Express的复杂性科学论文精选。如果Complexity Express列表中有你感兴趣的论文,欢迎点赞推荐,我们会优先组织解读~
 
1.进化计算的生物学视角
 
期刊来源:
Nature Machine Intelligence 
论文题目:
A biological perspective on evolutionary computation
论文地址:
https://www.nature.com/articles/s42256-020-00278-8

进化计算受到生物进化机制的启发。随着算法的改进与计算资源的提升,进化计算已经在部分具有挑战性的实际问题中,提出了众多创新性的解决方案。但是,大多数研究人员认为当今的数字进化系统缺乏生物器官和生态系统的复杂性、灵活性和可塑性。进化的神经网络距离生物学上的复杂性还很远,依然有巨大的发展空间。
 

进化计算基本原理
 
2021 年 1 月 18 日,Nature Machine Intelligence 在线发布综述,将当今的进化计算与生物进化进行对比,评估了进化计算未来的提升空间。这篇综述考虑了一些公认的生物进化特征:开放性、组织结构的重大转变、中性突变与遗传漂变、多目标性、复杂的基因型到表型作图以及共同进化等。进化计算已经在某种程度上发挥了巨大作用,展望未来,进化计算可以通过扩大可用计算范围并通过更仔细地模拟生物学来实现更高功能。
 

2.森林结构复杂性的全球模式与气候影响
 期刊来源:Nature Communications论文题目:Global patterns and climatic controls of forest structural complexity论文地址:https://www.nature.com/articles/s41467-020-20767-z
气候变化将改变全球森林生态系统的结构与功能,其中森林结构的复杂性在调节森林生态系统功能中起着至关重要的作用,同时也强烈影响生物多样性。然而气候变化对于不同地理位置的森林影响是截然不同的,目前学界对森林结构复杂性的全球模式和决定因素的了解仍然很少。 2021 年 1 月 22日发表在 Nature Communications 的一篇论文,量化了寒带、温带、亚热带及热带原始森林的结构复杂性,发现森林结构复杂性的全球变化在很大程度上是由年降水量和降水季节性所决定的。研究者以原始森林的结构复杂性为基准,对整个生物群落的潜在结构复杂性进行建模,并提供了地球森林生态区潜在结构复杂性的全球地图。 跨生物群落的森林生态区域中的潜在结构复杂性
 研究揭示了森林结构的不同纬度格局,并显示出森林结构高度复杂的区域与植物多样性的区域一致。同时还强调了在模拟气候变化对生物多样性和生态系统功能的影响时,需要整合森林结构的复杂性。要更好地预测生物多样性和生态系统功能的变化,就需要深入了解不断变化的气候条件、干扰机制、生态系统弹性和森林结构复杂性之间的反馈机制。
 
3.话题不同,极端言论却相似:
多维主题空间中极端观点的涌现
 期刊来源:Physical Review X论文题目:Emergence of Polarized Ideological Opinions in Multidimensional Topic Spaces论文地址:https://journals.aps.org/prx/abstract/10.1103/PhysRevX.11.011012
在公共领域中的意见分歧,已经不再是简单的观点表述,有时甚至会成为沦为党同伐异的争斗。不过,在各种公众热议的话题中,我们会发现不同话题中的偏激言论,经常呈现出一些相关性。但在分析这些现象成因时,所面临的挑战就在于如何在没有先验信息、背景信息的情况下获得这种相关性。2021年 1 月 20 日发表在 Physical Review X 的一篇论文,利用多维向量空间刻画了观点互动与两极分化的机制。 社交网络中立场演化示意图 该研究并没有假设不同的立场维度之间一定是正交的。通过把不同的信息投射到位于多个立场的高维空间中的向量,研究者认为观点的相关性是由人社交时的趋同性导致的,而且持有类似立场的人会彼此强化观点。该研究还表明,观点的转变是由话题争议性所驱动的,话题越有争议,观点之间就越有可能形成关联。
   4.纵观历史的气候变化预测
 期刊来源:Science Advances论文题目:Making climate projections conditional on historical observations论文地址:https://advances.sciencemag.org/content/7/4/eabc0671
对气候变化规律的分析与预测一直以来都是重要的科学研究课题,也常常成为影响经济政治的公众话题。但以往的分析模型主要通过对近期数据的分析来预测气候变化,因此预测能力非常有限。在 2021年 1 月 22 日发表在 Science Advances 上的一项研究中,三位来自法国与加拿大的研究者提出了一个可以利用历史观测数据进行气候变化预测的新模型。 在新的模型中,研究者使用了66个历史数据与SSP5-8.5气候情景的模拟链接。并使用了每个情景的伪观测数据。 该研究发现,历史观测数据对预测未来气候变暖的不确定性约为50%。因为改进了统计的方法,该研究可以利用完成的观测记录,对过去与未来的气候变化进行精准的评估,降低了气候变化预测中的不确定性。同时,这项研究也表明人类活动对气候的影响比以往的估计要高很多。
 5.皮层体感网络的时间尺度不变性
 期刊来源:PNAS论文题目:Invariant timescale hierarchy across the cortical somatosensory network论文地址:https://www.pnas.org/content/118/3/e2021843118
皮质网络整合来自不同来源的信息的能力对于认知过程至关重要。一方面,感觉区域(sensory areas)反应十分迅速,通常与刺激相互锁相(phase-locked)。另一方面,对刺激的反应潜伏期较慢的额叶区域(frontal lobe areas)必须整合并保持较长时间的信息。因此,皮质区域根据其功能角色可能需要不同的时间尺度。
触觉时间模式识别任务(TPDT)、表现及测试区域 (A)TPDT试验的事件顺序 (B)试验表现 (C)单个神经元在大脑中的位置 2021 年 1 月 19 日发表在 PNAS 上的 一篇文章针对皮层体感网络进行研究,通过区分两种震动触觉刺激模式发现皮层区域的内在时间尺度具有层次结构。重要的是,这种固有的时间尺度层次结构与任务情境无关。即使任务情境严重影响了S1下游皮质区域的神经编码,它们的时间尺度仍然不受影响。 

6.生长树的历史推断、模型选择与组合学
 期刊来源:
Physical Review Letters论文题目:Inference, Model Selection, and the Combinatorics of Growing Trees论文地址:https://journals.aps.org/prl/abstract/10.1103/PhysRevLett.126.038301
对于复杂网络演化历史的详细描述是十分具有价值的信息。流行病预测、结构推断以及增长模型都得可以从中获益。然而,该信息通常是难以获得的(如古代文明发展网络或生物演化网络)或无法得到完整的时间描述的(如无法实时采样的生态系统或演化成本太高的庞大网络)。因此推断复杂网络演化历史具有重要的研究价值。最近的研究表明,至少在“生长(growing)”网络——只增加节点而不删除节点的网络中推断网络演化历史是可行的。只要可以重构网络的时间演化,就可以进行推断。
计算当前树结构可能的演化历史 (a)以白色节点为根得到树的当前状态 (b)共有(6!/1!2!3!)=60种方法可以生成当前的三个子树 (c)对于每种方法都有2种具体的节点添加顺序(交换5节点与6节点),因此可能的历史情况共有2×60=120种 2020 年 1 月 22日发表在 Physical Review Letters 上的一篇文章针对生长树(growing trees)这一简单的“生长”网络模型引入了计数(counting)和直接采样(direct sampling)两种方法解决了现有模型准确度低、重构结果不完整、扩展性差等问题。并在人工与真实网络中验证了该方法的可行性。

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