Cell速递:信息论视角下的衰老:表观遗传信息丢失是哺乳动物衰老的原因之一
关键词:衰老,表观遗传,信息论,熵增
论文题目:Loss of epigenetic information as a cause of mammalian aging 论文来源:Cell 论文地址:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01570-7
所有有生命之物都会经历熵增,具体表现为基因及表观信息的丢失。在酵母中,表观信息随时间的丢失,是由于染色质修改蛋白由于 DNA 断裂导致的重定位使其失去自身特征,这是酵母衰老的标志之一。使用ICE(人工诱导的表观基因组改变),该研究 DNA 修复发现在生理、认知及分子层面加速了衰老,包括侵蚀表观基因景观、细胞分化、衰老及DNA甲基化进程的加速。而DNA甲基化时钟可以通过OSK介导的机制逆转,这也符合信息论视角下对衰老的理解,即由于信息丢失是一个可逆的衰老原因。
衰老的标志,是细胞功能和状态随时间的改变,然而这只是从硬件层面来看;从软件来看,生命是信息与环境的交互下涌现的模式,当关键信息丢失,生命对应的系统就会出故障,这是基于信息论对衰老的解释。存储生命所需的信息不止是DNA序列(基因组),还包括对DNA的修饰(甲基化)。后者被称为表观基因组,可决定DNA序列是否被表达。如将DNA看成是图纸,表观基因组存储的则是脚注,标出是否要组装这一零件。
当细胞复制时,不仅会积累新发突变,改变基因组,还会忽略原细胞上的表观信息,即改变表观基因组。在人工诱导改变小鼠的表观基因组后,发现小鼠的表观年龄增加(图1),且ICE小鼠由于实验处理,导致表观信息丢失后,衰老过程加速(图2)。
该研究还指出,上述表观遗传失调引起的衰老并非不可逆,通过基因疗法,修改3种干细胞活跃的基因 Oct4、Sox2 和 Klf4,可以帮助实验小鼠的细胞恢复到年轻状态,让表观遗传失调的细胞重新启动。这为恢复细胞活力,控制衰老提供了新的思路。
图1. 正常和ICE小鼠的表观年龄
图2. ICE与正常小鼠的生理表现
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