关键词：代谢网络，自然演化，灵敏度相关性



论文题目：Functional comparison of metabolic networks across species
论文来源：Nature Communications
论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-023-37429-5

代谢表型（Metabolic phenotypes）在许多领域（如生物地球化学循环、人类健康）都很重要，探索代谢功能多样性的驱动因素需要解开代谢基因库、已实现的代谢表型、进化与环境特征之间错综复杂的关系。然而，我们应如何推断这些联系，确定代谢表型？仍然悬而未决。

最近发表在 Nature Communications 的这篇文章使用灵敏度相关性（sensitivity correlations）来量化所预测代谢网络响应扰动的相似性，进而将基因型和环境与表型联系起来。

他们发现：这些相关性通过捕捉网络环境如何塑造基因功能，为基因组信息提供了一致的功能补充。这有助于在生物体水平上跨物种进行系统发育推断。他们以245种细菌为例，确定了保守和可变的代谢功能，阐明这些功能的演化历史和生态位的定量影响，并作出了相关的代谢表型的假设。

图1. 代谢网络的功能比较

图2. 系统发育分析



编译｜朱欣怡



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